吉林大学水资源与环境研究所是在原长春地质学院应用水文地质研究所（成立于1991年）的基础上，于2001年3月正式成立的专门从事水资源与环境研究的校属院管科研机构，首任所长为我国著名水文地质与环境地质学家林学钰院士，依托单位为国产偷拍自拍
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研究所以东北寒区为主要研究区并辐射我国北方，以地下水与环境演变及调控为主要研究方向,先后承担和完成国家和省（部）级重要科研任务300余项，在地下水可持续开发利用、水文地球化学过程与模拟、地下水土污染控制与修复等领域的基础理论和关键技术上取得了一批具有重要影响的研究成果，在地下水寻找与开发利用、地下水资源科学管理、地下水土污染修复关键材料与工艺研发等方面逐渐形成了自己的特色和优势。研究成果先后获得国家及省（部）级奖励23项，其中国家科技进步二等奖1项、省（部）级科技成果（进步）奖一等奖6项、二等奖10项；出版学术专著30部。
建所以来，研究所已先后培养包括博士后、博士、硕士等在内的高级人才350余名，其中博士后30名，博士生65名（包括5名外籍博士生），所培养的伊朗博士生Manouchehr Chistsazan是我国最早培养的理工专业外国博士生之一。
研究所与国内外著名高校、科研院所和企业具有广泛密切的合作联系。
目前研究所现有成员15人，其中中国科学院院士1名，教授11名，已形成了一支融合地下水科学与工程、水文水资源、环境科学与工程等多学科交叉研究团队，先后获得吉林省中青年科技创新团队和自然资源高层次科技创新人才工程科技创新团队等称号。
